Rockville/Maryland
. Forscher des Institute
for Genomic Research (TIGR) haben das Genom des
Bakteriums der Gattung Shewanella oneidensis geknackt. Das Bakterium ist
für seine Metall-abbauenden Eigenschaften bekannt und besitzt großes
Potenzial als Bio-Sanierungsmittel zur Entfernung toxischer
Metalle aus
der Umwelt. Die Entschlüsselung des Genoms soll neues Licht auf die
biochemischen Stoffwechselwege, durch die
Chrom,
Uran und andere giftige
Metalle reduziert werden, werfen. Mit einem ebenfalls entdeckten
bakteriellen Phagen soll die Möglichkeit der Manipulation des Bakteriums
in Betracht gezogen werden, um es in spezifischen Bio-Sanierungsprojekten
einzusetzen.
Das Shewanella-oneidensis-Genom enthält knapp fünf Mrd. Basenpaare mit
einem kreisförmigen Chromosom aus 4.758 Genen und einem kleinen
DNA-Plasmidring aus 173 Genen. Das Genom enthält laut Analyse eine
ungewöhnlich hohe Zahl an Cytochromen. Diese
Enzyme stehen mit dem
Elektronentransport in Verbindung und sind der Schlüssel zum
Mikroben-Potenzial für Bio-Sanierungsprojekte. Dieses Potenzial soll
durch eine genetische Manipulation des Bakteriums durch den
labmda-förmigen Phagen erhöht werden.
"Shewanella oneidensis ist die erste sequenzierte Mikrobe, die für die
biologische Sanierung eingesetzt werden kann und sowohl in einer aeroben
als auch in einer sauerstofffreien Umgebung überlebt", erklärte
TIGR-Forscher John F. Heidelberg. S. oneidensis ist ein stäbchen-förmiges
Bakterium und findet sich in See- und Flusssedimenten rund um die Welt.
Das Bakterium ist eine relativ einfache Mikrobe mit ungewöhnlichen
Eigenschaften. Es besitzt verschiedene Möglichkeiten zur Atmung. Diese
umfassen ein komplexes Elektronen-Transport-System, um Ionen von Metallen
wie Chrom und Uran zu reduzieren. Dabei wird eine Bio-Sanierung
(Bioremediation) in Gang gesetzt, durch die in
Wasser gelöste metallische
Schadstoffe entfernt werden. Ziel von TIGR, einem
Non-Profit-Forschungsinstitut unter der Leitung von Claire M. Fraser, ist
es, in der Folge eine große Bandbreite von Umweltbakterien zu
sequenzieren.