Nouvel espoir contre les superbactéries : une molécule totalement nouvelle a été identifiée
Découverte d'un candidat antibiotique prometteur
Une équipe internationale de chercheurs, dirigée par l'Université de Vienne et l'Institut Helmholtz de recherche pharmaceutique de la Sarre, a découvert la saarvienine A, un nouveau type d'antibiotique glycopeptidique. Leurs résultats, publiés aujourd'hui dans la revue Angewandte Chemie International Edition, présentent un composé ayant une forte activité contre les souches bactériennes hautement résistantes.
Les infections résistantes aux antibiotiques sont en augmentation et menacent de rendre à nouveau mortelles des maladies courantes. En l'absence de nouveaux antibiotiques, les experts préviennent que jusqu'à 100 millions de vies pourraient être perdues chaque année d'ici à 2050. À la recherche de nouveaux composés, des chercheurs de plusieurs institutions, dont l'université de Vienne et l'Institut Helmholtz de recherche pharmaceutique de la Sarre (HIPS), se sont tournés vers l'étude des actinobactéries - des micro-organismes bien connus pour vivre dans des environnements inhabituels et produire des antibiotiques tels que la vancomycine, la rifamycine et la chélocardine. Jaime Felipe Guerrero Garzón, de la division de pharmacognosie du département des sciences pharmaceutiques de l'université de Vienne, a découvert une forte activité antibiotique dans des extraits d'une souche d'Amycolatopsis isolée dans une mine de terres rares chinoise, ce qui l'a incité à poursuivre ses recherches. Martin Zehl, chef du centre de spectrométrie de masse de l'université de Vienne, a découvert que cette activité antibiotique était associée à un composé potentiellement nouveau de la classe des glycopeptides. En utilisant la spectrométrie de masse et la spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN), l'équipe collaboratrice de l'HIPS a identifié une molécule totalement nouvelle : la saarvienine A.
Briser les règles : Un glycopeptide qui a du plomb dans l'aile
La particularité de la saarvienine A est apparue très vite : contrairement aux glycopeptides établis tels que la vancomycine, le nouveau composé ne se lie pas à la cible bactérienne typique impliquée dans la synthèse de la paroi cellulaire. Au contraire, il agit probablement par le biais d'un mécanisme différent, qui n'a pas encore été élucidé. L'analyse structurelle a révélé une architecture particulière : un noyau peptidique halogéné cyclisé par une liaison uréido inhabituelle, décoré d'une chaîne de cinq unités de sucre et d'aminosucre - dont deux sont totalement nouvelles pour les produits naturels. "Nous avons été ravis de constater que la saarvienine A n'entre dans aucune catégorie connue", a déclaré Jaime Felipe Guerrero. "Sa structure unique pourrait ouvrir la voie à des antibiotiques que les bactéries n'ont jamais rencontrés auparavant.
Une arme puissante contre les bactéries résistantes
En étroite collaboration, les chercheurs de l'HIPS, dirigés par l'auteur correspondant Rolf Müller, ont caractérisé l'activité biologique de la saarvienine A, nommée d'après Sarrebruck et Vienne. Les tests de la nouvelle molécule contre les bactéries se sont concentrés en particulier sur les "pathogènes ESKAPE" - un groupe notoire de superbactéries connues pour échapper à la plupart des antibiotiques actuels. Le composé a montré une activité remarquable contre les entérocoques résistants à la vancomycine et les staphylocoques dorés résistants à la méthicilline (MRSA), y compris 3 pathogènes ESKAPE et 26 isolats cliniques. Il a toujours été plus performant que la vancomycine, même contre des souches déjà résistantes à plusieurs autres antibiotiques. "La découverte d'un nouvel antibiotique n'est qu'un début", a déclaré l'auteur correspondant, Sergey B. Zotchev, de l'université de Vienne. "Nous sommes maintenant confrontés au défi fascinant de l'affiner pour en faire un candidat-médicament adapté à l'usage clinique.
Prochaines étapes : Ingénierie pour la clinique
Les gènes de biosynthèse de la saarvienine A ayant déjà été identifiés et clonés, l'équipe internationale prévoit d'utiliser la chimie médicinale et l'ingénierie de la biosynthèse pour optimiser la molécule. L'un des principaux objectifs est de réduire la cytotoxicité tout en maintenant l'activité antibactérienne. Bien qu'il reste des défis à relever, la découverte de la saarvienine A donne un élan indispensable à la lutte contre la résistance aux antibiotiques et met en lumière le potentiel des sources naturelles inexplorées.
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