Nouvelle méthode d'analyse des protéines
Le procédé est universel et ne nécessite pas d'appareils spéciaux coûteux
Une équipe internationale dirigée par la clinique universitaire de Hambourg-Eppendorf (UKE) a mis au point une nouvelle méthode d'analyse à haute résolution des échantillons de tissus. Le procédé "Pathology-oriented MultiPlexing (PathoPlex)" permet d'analyser simultanément plus de 100 protéines différentes dans un seul échantillon de tissu. Le procédé est universel et ne nécessite pas d'appareils spéciaux coûteux. Les scientifiques espèrent que ce nouveau procédé permettra d'identifier les modifications à l'origine de maladies, par exemple dans les reins, et de mettre en place des thérapies personnalisées. Victor Puelles de la IIIe clinique médicale et polyclinique de l'UKE, avec la participation de l'Institut de biologie des systèmes médicaux, ont publié leur étude dans la revue spécialisée Nature.
Une percée technologique avec une résolution exceptionnelle
PathoPlex fonctionne par cycles qui se répètent pas à pas : différentes protéines sont d'abord marquées avec des anticorps, puis des images sont prises, les anticorps sont ensuite retirés et le cycle suivant est lancé pour colorer d'autres protéines. Dans l'étude, les chercheurs ont effectué 95 cycles d'imagerie de ce type. La microscopie confocale a permis de saisir un total de 600 milliards de points d'image avec une résolution de pixel de 80 nm, soit environ 1000 fois plus petite qu'un cheveu humain.
"Un avantage décisif de PathoPlex est sa compatibilité avec presque tous les microscopes à fluorescence, des simples microscopes à grand champ aux systèmes confocaux à haute résolution", explique le professeur Puelles, responsable de l'étude et dernier auteur. La méthode utilise à cet effet des anticorps disponibles dans le commerce et peut traiter jusqu'à 40 échantillons d'archives en parallèle. Pour gérer les grandes quantités de données, les chercheurs ont développé le logiciel "spatiomic", qui identifie automatiquement les modèles de coexpression des protéines, permet des analyses spatiales et est librement disponible.
Nouvelles connaissances sur les maladies rénales
Lors de l'étude des maladies rénales diabétiques avec PathoPlex, les scientifiques ont identifié des signaux de stress dans les tubules rénaux comme étant de nouveaux effets susceptibles de déclencher la maladie. Des modifications ont également pu être détectées chez des patients diabétiques de type 2 sans perte de fonction rénale - un pas important vers une amélioration du dépistage précoce et du traitement des complications du diabète. En outre, la méthode s'est avérée appropriée pour évaluer l'effet des antidiabétiques tels que les inhibiteurs SGLT2 dans ce groupe de patients.
Coopération internationale
Cette étude multidisciplinaire est le fruit d'une coopération entre l'UKE et l'Université d'Aarhus (Danemark) ainsi que de nombreux chercheurs internationaux au Japon, en Allemagne, en Australie, en France, en Suisse et aux États-Unis. Le projet a été soutenu, entre autres, par la Deutsche Forschungsgemeinschaft et le ministère fédéral allemand de la Recherche, de la Technologie et de l'Espace.
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Allemand peut être trouvé ici.
Publication originale
Kuehl, Puelles et al. Pathology-oriented multiplexing enables integrative disease mapping. Nature. 2025.
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