Difusión de una nueva variante del SARS-CoV-2 en toda Europa en el verano de 2020

Actualmente no hay pruebas de que esta variante sea más peligrosa

30.10.2020 - Suiza

Investigadores de Basilea y España han identificado una nueva variante del SARS-CoV-2 que se ha extendido ampliamente por toda Europa en los últimos meses, según una preimpresión no revisada por pares publicada esta semana. Si bien no hay pruebas de que esta variante sea más peligrosa, su propagación puede dar una idea de la eficacia de las políticas de viaje adoptadas por los países europeos durante el verano.

Nextstrain, Mapbox, OpenStreetMap

La nueva variante 20A.EU1 del SARS-CoV-2 se ha extendido ampliamente por toda Europa. Visualización de los números de secuencia (diámetro de los círculos), codificados por colores por país. Abajo a la derecha: El "árbol genealógico" de secuencias de la nueva variante (codificado por colores por país) indica que 20A.EU1 viajó entre países varias veces.

Sólo en Europa circulan actualmente cientos de variantes diferentes del nuevo coronavirus SARS-CoV-2, que se distinguen por las mutaciones de sus genomas. Sin embargo, sólo muy pocas de esas variantes se han propagado con tanto éxito y han llegado a ser tan prevalentes como la variante recientemente identificada, denominada 20A.EU1.

Los investigadores de la Universidad de Basilea, el ETH de Zurich en Basilea y el consorcio SeqCOVID-España analizaron y compararon las secuencias del genoma del virus recogidas de los pacientes de Covid-19 en toda Europa para seguir la evolución y la propagación del patógeno. Su análisis sugiere que la variante se originó en España durante el verano. La primera evidencia de la nueva variante está relacionada con un evento de súper propagación entre los trabajadores agrícolas del noreste de España. La variante se trasladó a la población local, expandiéndose rápidamente por todo el país, y ahora representa casi el 80% de las secuencias de España.

"Es importante señalar que actualmente no hay pruebas de que la propagación de la nueva variante se deba a una mutación que aumente la transmisión o que afecte al resultado clínico", subraya la Dra. Emma Hodcroft, de la Universidad de Basilea, autora principal del estudio. Los investigadores creen que la expansión de la variante se facilitó al aflojar las restricciones de viaje y las medidas de distanciamiento social en verano.

Un patrón similar al de la primavera en España

"Vemos un patrón similar con esta variante en España como lo hicimos en la primavera", aconseja el profesor Iñaki Comas, co-autor del artículo y jefe del consorcio SeqCOVID-España. "Una variante, ayudada por un evento inicial de súper dispersión, puede llegar a prevalecer rápidamente en todo el país."

A partir de julio, 20A.EU1 se movió con los viajeros a medida que se abrían las fronteras en toda Europa, y ahora se ha identificado en doce países europeos. También se ha transmitido desde Europa a Hong Kong y Nueva Zelandia. Si bien es probable que las introducciones iniciales de la variante procedieran directamente de España, es posible que la variante siguiera extendiéndose a partir de países secundarios.

Actualmente, 20A.EU1 representa el 90% de las secuencias del Reino Unido, el 60% de las secuencias de Irlanda y entre el 30 y el 40% de las secuencias de Suiza y los Países Bajos. Esto hace que esta variante sea actualmente una de las más prevalentes en Europa. También se ha identificado en Francia, Bélgica, Alemania, Italia, Letonia, Noruega y Suecia.

Los viajes facilitaron la propagación

Los análisis genéticos indican que la variante viajó por lo menos docenas y posiblemente cientos de veces entre los países europeos. "Podemos ver que el virus se ha introducido varias veces en varios países y que muchas de estas introducciones se han extendido por la población", dice la profesora Tanja Stadler de la ETH Zürich, una de las principales investigadoras del estudio.

Aunque el aumento de la prevalencia de 20A.EU1 se corresponde con el creciente número de casos observados en muchos países europeos este otoño, los autores del estudio advierten que no hay que interpretar la nueva variante como una causa del aumento de los casos. "No es la única variante que ha circulado en las últimas semanas y meses", dice el profesor Richard Neher de la Universidad de Basilea, uno de los principales investigadores del estudio. "De hecho, en algunos países con aumentos significativos de casos de Covid-19, como Bélgica y Francia, prevalecen otras variantes".

El análisis de la prevalencia del SARS-CoV-2 en España durante el verano y los datos sobre viajes muestran que estos factores pueden explicar cómo se propagó 20A.EU1 con tanto éxito. El número relativamente alto de casos y la popularidad de España como destino de vacaciones pueden haber permitido múltiples oportunidades de introducción, algunas de las cuales pueden haberse convertido en brotes más grandes por medio de comportamientos de riesgo después de regresar a casa.

Los autores del estudio destacan la importancia de evaluar cómo funcionaron los controles fronterizos y las restricciones de viaje para contener las transmisiones de SARS-CoV-2 durante el verano, y el papel que han jugado los viajes. "Los cierres de fronteras a largo plazo y las severas restricciones de viaje no son factibles ni deseables", explica Hodcroft, "pero a partir de la propagación del 20A.EU1 parece claro que las medidas en vigor a menudo no fueron suficientes para detener la transmisión de las variantes introducidas este verano". Cuando los países se han esforzado por reducir los casos de SARS-CoV-2 a cifras bajas, es fundamental identificar mejores formas de 'abrirse' sin arriesgar un aumento de los casos".

Evaluar el fenotipo de la nueva variante

La nueva variante fue identificada por primera vez por Hodcroft durante un análisis de las secuencias suizas utilizando la plataforma 'Nextstrain', desarrollada conjuntamente por la Universidad de Basilea y el Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson en Seattle, Washington. 20A.EU1 se caracteriza por las mutaciones que modifican los aminoácidos en la espiga, la nucleocápside y las proteínas ORF14 del virus.

Aunque el estado actual de los conocimientos no indica que la propagación de 20A.EU1 se deba a un cambio en la transmisibilidad, los autores están trabajando actualmente con laboratorios de virología para examinar cualquier impacto potencial que la mutación de la espiga, conocida como S:A222V, pueda tener en el fenotipo del virus SARS-CoV-2. También esperan recibir pronto acceso a datos que les permitan evaluar cualquier repercusión clínica de la variante.

Además, los autores del estudio destacan la importancia de vigilar de cerca el aumento de nuevas variantes como la 20A.EU1: "Sólo mediante la secuenciación del genoma viral podemos identificar las nuevas variantes del SARS-CoV-2 cuando surgen y vigilar su propagación dentro de los países y entre ellos", añade Neher, "pero el número de secuencias que tenemos varía mucho de un país a otro, y tal vez podamos identificar antes las variantes en aumento con esfuerzos de secuenciación más rápidos y regulares en toda Europa".

Nota: Este artículo ha sido traducido utilizando un sistema informático sin intervención humana. LUMITOS ofrece estas traducciones automáticas para presentar una gama más amplia de noticias de actualidad. Como este artículo ha sido traducido con traducción automática, es posible que contenga errores de vocabulario, sintaxis o gramática. El artículo original en Inglés se puede encontrar aquí.

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