SRAS-CoV-2 : le traitement antiviral favorise l'émergence de nouveaux variants
Analyse de la diversité génomique dans les infections prolongées
Les patients atteints d'infections prolongées contribuent-ils à l'émergence de nouveaux variants du SRAS-CoV-2 ? Une équipe de chercheurs de l'Institut Leibniz de virologie (LIV) et du Centre médical universitaire de Hambourg-Eppendorf (UKE) a étudié cette question plus en détail et a pu montrer que ce n'est pas l'infection prolongée en soi qui conduit à l'émergence de nouveaux variants. Il faut plutôt un goulot d'étranglement évolutif tel qu'il peut être créé par un traitement antiviral. Les résultats sont maintenant publiés dans la revue Cell Reports Medicine en version pré-preuve.
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Les infections prolongées par le SRAS-CoV-2 surviennent principalement chez les patients immunodéprimés et ont été évoquées à plusieurs reprises comme des facteurs importants de l'évolution virale : La réduction de la restriction immunitaire pourrait conduire à une large augmentation de la diversité virale au sein de l'hôte, favorisant l'émergence de nouveaux variants, en particulier si les traitements antiviraux tels que le Remdesivir ou le plasma convalescent exercent une pression de sélection pour l'acquisition de mutations d'échappement.
Analyse de la diversité génomique dans les infections prolongées
Dans l'étude publiée, une équipe de recherche dirigée par le professeur Adam Grundhoff (LIV) et le professeur Nicole Fischer (UKE) a maintenant cherché à savoir si les patients atteints d'infections prolongées présentent généralement une évolution virale accrue, ce qui pourrait permettre l'émergence plus rapide de variantes du SRAS-CoV-2, ou si certains régimes de traitement favorisent l'émergence de nouvelles mutations.
À cette fin, la diversité génomique au sein de l'hôte a été étudiée par séquençage du génome entier dans des échantillons longitudinaux provenant de 14 patients présentant une persistance virale prolongée (30 - 146 jours) au cours d'une maladie grave de type COVID-19 ; y compris des patients immunodéprimés et immunocompétents avec ou sans traitement antiviral afin d'évaluer l'occurrence de mutations avec et sans pression de sélection.
"Dans l'ensemble, le virus était remarquablement stable chez la grande majorité des individus étudiés. Cependant, chez un patient traité au Remdesivir, nous avons observé qu'un grand nombre de mutations sont apparues immédiatement après le début du traitement - y compris au moins une mutation qui était très susceptible de conférer une résistance accrue au Remdesivir", explique le professeur Adam Grundhoff, chef du groupe de recherche sur la génomique du virus LIV.
Le traitement antiviral favorise un goulot d'étranglement évolutif
Les patients atteints d'une infection prolongée par le SRAS-CoV-2 et traités par l'antiviral Remdesivir ont présenté une augmentation significative de la diversité virale intra-hôte avec de nouvelles mutations émergentes. En revanche, chez les patients recevant uniquement un traitement anti-inflammatoire, l'émergence de nouveaux variants n'a été observée que de manière sporadique.
"Nos travaux montrent que ce n'est pas la longue durée de l'infection en soi qui conduit à l'émergence de nouveaux variants. Cela nécessite plutôt un goulot d'étranglement évolutif, tel qu'il peut être créé par un traitement antiviral. Ce résultat est particulièrement important au vu des récentes discussions sur l'utilisation du Remdesivir pour le traitement des patients à haut risque non hospitalisés, mais aussi pour l'introduction de nouvelles thérapeutiques antivirales potentielles", ajoute le professeur Nicole Fischer de l'UKE.
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
Publication originale
Andreas Heyer, Thomas Günther, Alexis Robitaille, Marc Lütgehetmann, Marylyn M. Addo, Dominik Jarczak, Stefan Kluge, Martin Aepfelbacher, Julian Schulze zur Wiesch, Nicole Fischer and Adam Grundhoff. Remdesivir-induced emergence of SARS-CoV-2 variants in patients with prolonged infection. Cell Reports Medicine (August 16, 2022).
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