une bactérie vieille de 5 000 ans défie 10 antibiotiques modernes
Les bactéries des grottes de glace pourraient aggraver la crise de la résistance aux antibiotiques - ou contribuer à la résoudre
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Les bactéries ont évolué pour s'adapter à toutes les conditions les plus extrêmes de la Terre, de la chaleur torride aux températures bien inférieures à zéro. Les grottes de glace ne sont qu'un des environnements abritant une variété de micro-organismes qui représentent une source de diversité génétique qui n'a pas encore fait l'objet d'études approfondies.
Grotte de glace de Scarisoara en Roumanie.
Paun V.I.
Aujourd'hui, des chercheurs roumains ont testé les profils de résistance aux antibiotiques d'une souche bactérienne qui, jusqu'à récemment, était cachée dans une couche de glace vieille de 5 000 ans dans une grotte de glace souterraine. Ils ont découvert que cette souche pourrait permettre d'élaborer de nouvelles stratégies pour prévenir l'augmentation de la résistance aux antibiotiques et d'étudier la façon dont la résistance évolue et se propage naturellement. Ils ont fait part de leur découverte dans la revue Frontiers in Microbiology.
"La souche bactérienne Psychrobacter SC65A.3 isolée dans la grotte de glace de Scarisoara, malgré son origine ancienne, présente une résistance à de nombreux antibiotiques modernes et porte plus de 100 gènes liés à la résistance", explique l'auteur, le Dr Cristina Purcarea, chercheur principal à l'Institut de biologie de Bucarest de l'Académie roumaine. Mais il peut également inhiber la croissance de plusieurs "superbactéries" résistantes aux antibiotiques et a montré d'importantes activités enzymatiques avec un potentiel biotechnologique important".
Résistance ancienne aux médicaments modernes
Psychrobacter SC65A.3 est une souche du genre Psychrobacter, une bactérie adaptée aux environnements froids. Certaines espèces peuvent provoquer des infections chez l'homme ou l'animal. Les bactéries Psychrobacter ont un potentiel biotechnologique, mais les profils de résistance aux antibiotiques de ces bactéries sont largement inconnus. "L'étude de microbes tels que Psychrobacter SC65A.3, prélevés dans des dépôts de glace de grottes datant de plusieurs millénaires, révèle comment la résistance aux antibiotiques a évolué naturellement dans l'environnement, bien avant que les antibiotiques modernes ne soient utilisés", a déclaré M. Purcarea.
L'équipe a prélevé une carotte de glace de 25 mètres dans la zone de la grotte connue sous le nom de "Great Hall", ce qui représente une période de 13 000 ans. Pour éviter toute contamination, les fragments de glace prélevés dans la carotte ont été placés dans des sacs stériles et conservés à l'état congelé jusqu'à leur retour au laboratoire. Là, les chercheurs ont isolé diverses souches bactériennes et séquencé leur génome afin de déterminer les gènes qui permettent à la souche de survivre à basse température et ceux qui lui confèrent une résistance et une activité antimicrobiennes.
Ils ont testé la résistance de la souche SC65A à 28 antibiotiques de 10 classes qui sont couramment utilisés ou réservés au traitement des infections bactériennes, y compris des antibiotiques qui ont été précédemment identifiés comme possédant des gènes de résistance ou des mutations qui leur confèrent la capacité de résister aux effets des médicaments. Ils ont ainsi pu vérifier si les mécanismes prédits se traduisaient par une résistance mesurable. "Les dix antibiotiques pour lesquels nous avons trouvé une résistance sont largement utilisés dans les thérapies orales et injectables utilisées pour traiter une série d'infections bactériennes graves dans la pratique clinique", a souligné Purcarea. Des maladies telles que la tuberculose, la colite et les infections urinaires peuvent être traitées avec certains des antibiotiques auxquels les chercheurs ont trouvé une résistance, notamment la rifampicine, la vancomycine et la ciprofloxacine.
SC65A.3 est la première souche de Psychrobacter pour laquelle une résistance à certains antibiotiques - dont la triméthoprime, la clindamycine et le métronidazole - a été trouvée. Ces antibiotiques sont utilisés pour traiter les infections urinaires, les infections des poumons, de la peau, du sang et du système reproducteur. Le profil de résistance du SC65A.3 suggère que les souches capables de survivre dans des environnements froids pourraient servir de réservoirs de gènes de résistance, c'est-à-dire de séquences d'ADN spécifiques qui les aident à survivre à l'exposition aux médicaments.
Un potentiel risqué
Les souches bactériennes telles que celle examinée ici représentent à la fois une menace et une promesse. "Si la fonte des glaces libère ces microbes, ces gènes pourraient se propager aux bactéries modernes, ce qui aggraverait le problème mondial de la résistance aux antibiotiques", a déclaré M. Purcarea. "D'un autre côté, ils produisent des enzymes et des composés antimicrobiens uniques qui pourraient inspirer de nouveaux antibiotiques, des enzymes industriels et d'autres innovations biotechnologiques."
Dans le génome de Psychrobacter SC65A.3, les chercheurs ont trouvé près de 600 gènes aux fonctions inconnues, ce qui suggère une source encore inexploitée pour la découverte de nouveaux mécanismes biologiques. L'analyse du génome a également révélé 11 gènes potentiellement capables de tuer ou d'arrêter la croissance d'autres bactéries, champignons et virus.
Ce potentiel devient de plus en plus important dans un monde où la résistance aux antibiotiques est une préoccupation croissante. Le fait de remonter à des génomes anciens et de découvrir leur potentiel met en évidence le rôle important joué par l'environnement naturel dans la propagation et l'évolution de la résistance aux antibiotiques. "Ces bactéries anciennes sont essentielles pour la science et la médecine", a conclu M. Purcarea, "mais il est essentiel de les manipuler avec précaution et de prendre des mesures de sécurité en laboratoire pour limiter le risque de propagation incontrôlée".
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
Publication originale
Victoria Ioana Paun, Corina Itcus, Paris Lavin, Mariana Carmen Chifiriuc, Cristina Purcarea; "First genome sequence and functional profiling of Psychrobacter SC65A.3 preserved in 5,000-year-old cave ice: insights into ancient resistome, antimicrobial potential, and enzymatic activities"; Frontiers in Microbiology, Volume 16, 2026-2-17
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