Séquençage de nouvelle génération : le prix de l'innovation EARTO décerné aux diagnostics basés sur la NGS pour l'identification des agents pathogènes de la septicémie

20.10.2025

Une méthode développée par l'Institut Fraunhofer pour l'ingénierie interfaciale et la biotechnologie (IGB) permet d'identifier les pathogènes bactériens, viraux, fongiques ou parasitaires chez les patients atteints de septicémie beaucoup plus rapidement qu'auparavant et avec la plus grande précision. L'approche est basée sur le séquençage à haut débit de l'ADN acellulaire circulant dans le sang et a été récompensée par le prix de l'innovation EARTO dans la catégorie "Impact Delivered" le 14 octobre 2025 à Bruxelles. Le kit de diagnostic est déjà approuvé pour l'indication de la septicémie et est disponible en tant que produit certifié IVD pour les soins de routine.

Piotr Banczerowski

Les chercheurs peuvent utiliser leur méthode pour détecter des fragments d'ADN pathogène dans le sang des patients et identifier ainsi les organismes responsables.

L'Association européenne des organismes de recherche et de technologie (EARTO) représente plus de 350 organismes de recherche et de technologie dans plus de 32 pays européens, dont l'Institut Fraunhofer d'ingénierie interfaciale et de biotechnologie (IGB). Depuis 2009, l'EARTO décerne ses prix annuels de l'innovation afin de reconnaître l'importante contribution de ses membres au développement de l'économie et de la société.

Lors de la cérémonie de remise des prix de cette année, qui s'est déroulée le 14 octobre 2025 à Bruxelles, une nouvelle approche du diagnostic des pathogènes chez les patients en soins intensifs a été récompensée. La méthode mise au point par le Fraunhofer IGB est basée sur le séquençage à haut débit, à l'aide du séquençage de nouvelle génération (NGS), du matériel génétique des agents pathogènes isolés dans le sang des patients. Le Dr Kai Sohn, directeur du département de diagnostic in vitro du Fraunhofer IGB, a reçu le deuxième prix dans la catégorie "Impact délivré".

Plus rapide et plus précis grâce au séquençage de l'ADN à haut débit

Dans la plupart des hôpitaux, les agents pathogènes de la septicémie sont encore détectés à l'aide d'hémocultures traditionnelles. Il s'agit de cultiver les bactéries dans un échantillon de sang du patient en laboratoire, ce qui entraîne des délais importants. Par conséquent, la détection de l'agent pathogène nécessaire à la mise en place d'une thérapie anti-infectieuse ciblée intervient souvent trop tard. En outre, les hémocultures ne donnent un résultat positif que dans 30 % des cas au maximum.

La nouvelle méthode de Fraunhofer utilise donc le matériel génétique des agents pathogènes ou des fragments de celui-ci dans le sang. Comme toutes les cellules, les différents agents pathogènes libèrent leur matériel génétique sous la forme de fragments d'ADN libre de cellules en circulation (cfDNA). Les chercheurs peuvent isoler et séquencer jusqu'à 30 millions de fragments d'ADN à partir d'un échantillon de sang. Si des fragments d'origine non humaine sont trouvés, les données de la séquence sont comparées à une base de données spécialement établie contenant les séquences génomiques de bactéries, de virus, de champignons et de parasites. Les agents pathogènes peuvent ainsi être identifiés de manière claire et fiable en l'espace de 24 heures seulement.

Impact obtenu : Des études cliniques confirment une identification très précise des agents pathogènes

Dans le cadre d'études cliniques menées par l'hôpital universitaire d'Essen, la nouvelle approche a été comparée aux normes de diagnostic antérieures. Les études confirment que la méthode NGS présente d'excellentes caractéristiques de performance : par exemple, l'agent pathogène responsable a été identifié dans plus de 60 % de tous les échantillons de sang examinés. Par rapport à l'hémoculture, le diagnostic NGS a abouti à un résultat positif quatre fois plus souvent au début de la septicémie et dix fois plus souvent trois jours après le début de la septicémie. Ce diagnostic précis est suivi d'une thérapie spécifiquement adaptée à l'agent pathogène en cause. Les patients peuvent ainsi quitter l'unité de soins intensifs et l'hôpital beaucoup plus rapidement et jouir d'une meilleure qualité de vie après leur sortie. Le traitement de la septicémie étant un facteur de coût important, les hôpitaux et les compagnies d'assurance maladie devraient s'en trouver sensiblement soulagés.

La procédure de diagnostic est distribuée commercialement par Noscendo GmbH, une entreprise dérivée de Fraunhofer IGB. Si les cliniques ne sont pas en mesure d'utiliser elles-mêmes la procédure dans des laboratoires centraux affiliés, la start-up offre la possibilité d'envoyer des échantillons à tout moment et de les faire analyser dans un délai très court. Au cours des cinq dernières années, cela a permis d'examiner les échantillons sanguins de plus de 15 000 patients.

Prix de l'innovation EARTO : Innovations au profit de l'économie et de la société

Le prix annuel de l'innovation de l'EARTO récompense une innovation ayant un impact social et/ou économique significatif et qui a été développée avec l'implication significative d'un membre de l'EARTO. Un jury indépendant évalue les candidatures et sélectionne le(s) lauréat(s). Dans la catégorie "Impact délivré", EARTO récompense les innovations qui sont déjà sur le marché et qui ont prouvé leur impact, tandis que la catégorie "Impact attendu" reconnaît les innovations qui ne sont pas encore sur le marché mais qui ont un grand potentiel.

Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.

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