Une plateforme conception enzymatique basée sur l'IA crée des enzymes sur mesure à partir de zéro
L’équipe lithuanienne figure parmi les 10 meilleurs innovateurs du Young Inventors Prize 2025
Les enzymes sont indispensables à de nombreux secteurs, allant de la médecine et de l’agriculture à l’industrie chimique. Cependant, leur développement repose encore largement sur la modification d’enzymes naturelles existantes — une approche top-down qui limite souvent leur efficacité et leur flexibilité. Laurynas Karpus (30 ans), Vykintas Jauniškis (29 ans), and Irmantas Rokaitis (28 ans) ont co-développé une plateforme innovante basée sur l’IA et la physique, qui permet de concevoir de nouvelles enzymes de A à Z. Cette méthode offre un contrôle amélioré, une efficacité optimisée et des cycles d’innovation accélérés. Leur invention leur a valu une place parmi les 10 meilleurs innovateurs du Young Inventors Prize 2025, appelés Tomorrow Shapers, qui récompense les jeunes inventeurs qui relèvent des défis mondiaux. Un jury indépendant les a sélectionnés parmi 450 candidats.
Repousser les limites de la conception des enzymes
Laurynas Karpus, Vykintas Jauniškis et Irmantas Rokaitis sont les fondateurs de Biomatter,et ont développé la plateforme Intelligent Architecture™, un outil alimenté par l'IA qui conçoit de nouvelles enzymes à partir de zéro, plutôt que de modifier celles qui existent déjà.
Dans ce domaine, l'ingénierie traditionnelle est limitée par des modèles naturels, ce qui rend souvent difficile l'adaptation des enzymes à de nouvelles applications. La plateforme de Biomatter adopte une approche bottom-up, utilisant l'IA pour concevoir des enzymes personnalisées répondant aux besoins spécifiques de l'industrie. En combinant l'apprentissage automatique, la modélisation basée sur la physique et des tests en conditions réelles, la plateforme améliore constamment ses conceptions. Le résultat est une production d'enzymes plus efficaces, évolutives et sur mesure, qui optimisent la bioproduction, le développement de médicaments et la production chimique durable.
Un modèle d'apprentissage automatique
Laurynas Karpus, Vykintas Jauniškis et Irmantas Rokaitis se sont rencontrés à l'Institut de biotechnologie de l'Université de Vilnius, où ils ont exploré pour la première fois la génération d'enzymes alimentée par l'IA en 2017. Leur travail préliminaire a conduit au développement de ProteinGAN, un modèle d'apprentissage automatique qui a généré avec succès des enzymes fonctionnelles. Encouragés par cette réussite, ils ont fondé Biomatter en 2018 aux côtés de Rolandas Meškys et Donatas Repečka pour introduire la conception d'enzymes alimentée par l'IA dans l'industrie.
D’après des études de marché, le marché mondial des enzymes est estimé à plus de 10 milliards d'euros en 2025 et pourrait atteindre 15 milliards d'euros d'ici 2034. La demande pour des solutions enzymatiques plus efficaces et évolutives est en pleine croissance. Depuis sa création, Biomatter a collaboré avec des entreprises de biotechnologie et pharmaceutiques de premier plan, dont Kirin, pour développer un processus de production évolutif d’oligosaccharides du lait humain (HMO), des nutriments essentiels à la santé des nourrissons. Ils ont également établi des partenariats avec ArcticZymes Technologies, entre autres, pour optimiser les enzymes utilisées dans la thérapie génique, la production de vaccins et la bioproduction.
« En développant une technologie de conception d’enzymes qui ne connaît pour limite que notre imagination, nous levons un verrou majeur dans la résolution des grands enjeux de santé et de durabilité du XXIᵉ siècle », racontent les trois fondateurs.
Le Young Inventors Prize récompense des innovateurs du monde entier, âgés de 30 ans ou moins, qui utilisent la technologie pour relever les défis mondiaux posés par les Objectifs de développement durable (ODD) des Nations Unies. L’invention de l’équipe lituanienne soutient les Objectifs de développement durable (ODD) 3 (bonne santé et bien-être) et 9 (industrie, innovation et infrastructure), en contribuant à un développement enzymatique plus efficace, au service de la santé, de l’industrie et de la durabilité.
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