La génomique pour la conservation de la biodiversité

Les analyses génomiques fournissent des informations importantes pour la gestion de la conservation.

28.02.2023 - Allemagne

La conservation de la biodiversité de la nature est l'un des grands défis de notre époque. Pour élaborer des stratégies et des mesures efficaces, il faut des analyses scientifiques bien fondées et des informations concrètes pour les acteurs de la conservation de la nature. Le domaine de la génomique de la biodiversité peut apporter une contribution importante à cet égard : les données génomiques des espèces, des communautés d'espèces et des écosystèmes entiers donnent un aperçu des caractéristiques, des capacités d'adaptation, des relations et des développements évolutifs. Ces données devraient toujours être prises en compte dans les évaluations et les décisions de grande portée en matière de gestion de la conservation de la nature. C'est ce que préconise une équipe internationale de scientifiques de Francfort, entre autres, dans une nouvelle publication parue dans la revue scientifique "Trends in Genetics".

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La crise actuelle de la biodiversité a des conséquences dévastatrices sur le fonctionnement et la santé des écosystèmes, le patrimoine évolutif et le potentiel d'adaptation des espèces. À terme, elle menace également l'humanité. Bien que la diversité génétique soit depuis longtemps reconnue comme fondamentale à tous les niveaux de l'organisation biologique - des individus, des populations et des espèces aux communautés et aux écosystèmes - la génomique est souvent négligée dans les évaluations de la biodiversité et les mesures de conservation, affirment les scientifiques dans leur article. Ils en voient les raisons dans le transfert limité de connaissances, la coopération interdisciplinaire restreinte et l'absence de directives internationales correspondantes.

Pour démontrer les nombreux avantages et les applications possibles des données génomiques, l'équipe donne un aperçu des approches et des applications les plus importantes de la génomique de la biodiversité. Alors que la biodiversité d'écosystèmes entiers peut être analysée au moyen de ce que l'on appelle le métabarcodage de l'ADN, le niveau de détail de l'étude des organismes individuels peut être adapté à la question respective de la conservation des espèces.

"Par exemple, les données génomiques peuvent être utilisées pour déterminer la capacité d'une espèce à s'adapter à des conditions environnementales changeantes de manière beaucoup plus réaliste. Les paramètres importants pour la gestion de la conservation, tels que la consanguinité ou le flux génétique, qui est l'échange de matériel génétique au sein d'une population ou entre des populations, peuvent également être décrits de manière très fiable en analysant des génomes entiers. Avec notre publication, nous souhaitons promouvoir les coopérations entre les chercheurs des domaines de la conservation et de la génomique de la biodiversité afin de guider une nouvelle ère de la génomique de la conservation dans l'Anthropocène - l'ère dans laquelle les humains sont devenus l'un des facteurs les plus importants influençant les processus biologiques, géologiques et atmosphériques sur terre", explique le Dr Kathrin Theissinger, scientifique à la Société Senckenberg pour la recherche sur la nature et au Centre LOEWE de Hesse pour la génomique translationnelle de la biodiversité (LOEWE-TBG) et l'un des premiers auteurs de la publication.

Selon les chercheurs, les données des génomes de référence, c'est-à-dire les informations sur le génome d'une espèce analysée de manière exhaustive, fournissent un aperçu particulièrement fiable. "Nous voulons contribuer à rendre facilement disponibles et utilisables les génomes de référence de nombreuses espèces de l'ensemble de l'arbre du vivant. Ce trésor de données apportera une contribution cruciale à l'évaluation, au maintien ou à la restauration de la diversité biologique de notre planète", souligne Miklós Bálint, professeur de génomique environnementale fonctionnelle au Senckenberg, à l'université de Giessen et au LOEWE-TBG. "Pour l'objectif de déchiffrer et de comprendre la base génomique de cette diversité, Senckenberg et le LOEWE Centre TBG offrent d'excellentes conditions, notamment aussi pour la production de génomes de référence d'un large éventail d'espèces."

Des consortiums se sont formés ces dernières années pour les fournir. Parmi eux figure l'initiative European Reference Genome Atlas (ERGA), dont les membres sont également impliqués dans l'article. Le consortium ERGA s'est fixé pour objectif de former une communauté d'experts transdisciplinaire et transfrontalière. ERGA est la branche paneuropéenne officielle du projet Earth BioGenome, une initiative mondiale dont l'objectif est de séquencer et de cataloguer les génomes de toutes les espèces eucaryotes actuellement décrites sur Terre sur une période de dix ans. Le LOEWE Centre TBG est membre des deux initiatives.

Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.

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