Avances en la investigación sobre el cáncer: un nuevo programa informático facilita el análisis de imágenes tisulares complejas
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Gracias a las modernas técnicas de imagen, hoy en día es posible determinar, con una sola muestra de tejido, qué células están presentes en él y cómo están organizadas. Un avance que ha simplificado considerablemente el diagnóstico y la investigación de diversas enfermedades. Un equipo de investigación interdisciplinar de la Universidad Heinrich Heine de Düsseldorf (HHU), del Hospital Universitario de Düsseldorf (UKD) y del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL) ha desarrollado ahora un software que, en el futuro, servirá de apoyo para el análisis de estos resultados. Los investigadores han publicado sus resultados en la prestigiosa revista especializada *Nature Methods*.
La microscopía multiparamétrica detecta simultáneamente numerosas proteínas en una única muestra de tejido, como, por ejemplo, una biopsia de linfoma. De este modo, permite visualizar diferentes tipos de células y estructuras tisulares. El software spatialproteomics permite evaluar estos datos de forma sistemática y reproducible.
Los métodos modernos de microscopía permiten, mediante la obtención de imágenes multiparamétricas, crear una especie de mapa de las muestras de tejido que puede utilizarse en el estudio del tejido y, por ejemplo, para el diagnóstico. Para ello, los científicos tienen en cuenta varios aspectos, como la frecuencia o la distribución espacial de los distintos tipos de células. Esto resulta especialmente relevante para la investigación oncológica, ya que las células cancerosas no están aisladas, sino que interactúan estrechamente con las células inmunitarias, los vasos sanguíneos y las células del tejido conjuntivo. La disposición espacial de estas células puede influir en la evolución de una enfermedad y en la eficacia de un tratamiento. A diferencia de los estudios clásicos, en los que normalmente solo se analizan unas pocas características a la vez, la obtención de imágenes multiparamétricas permite caracterizar detalladamente desde miles hasta millones de células individuales, lo que puede facilitar la investigación y el diagnóstico del cáncer.
Sin embargo, el análisis de estas imágenes es complejo: es necesario identificar, medir y contar los distintos tipos de células. Solo entonces se puede investigar qué células presentan anomalías, por ejemplo, en forma de agrupaciones espaciales. Hasta ahora, para ello se necesitaban varios programas y pasos de análisis que requerían una laboriosa adaptación. Gracias al nuevo software «spatialproteomics», que los investigadores liderados por el autor principal Matthias Meyer-Bender (EMBL) acaban de presentar en la prestigiosa revista Nature Methods, este procedimiento se simplificará considerablemente en el futuro. Permite agrupar los distintos cortes de trabajo y acompaña el análisis de las imágenes microscópicas originales.
En su artículo, Matthias Meyer-Bender, el Dr. Peter-Martin Bruch (coautor último, HHU, UKD) y su equipo demostraron el funcionamiento del software tomando como ejemplo los linfomas no Hodgkin de células B. Gracias al uso del software, fue posible analizar la distribución de los distintos tipos celulares dentro de una biopsia. De este modo, spatialproteomics contribuyó a distinguir entre linfomas benignos y malignos.
«Los programas de análisis de fácil acceso son un requisito importante para que las nuevas tecnologías de imagen puedan utilizarse de forma generalizada. Reducen las barreras técnicas de acceso, mejoran la comparabilidad de los estudios y facilitan la evaluación reproducible de datos complejos», explica el autor principal, Meyer-Bender. Bruch añade: «De este modo, spatialproteomics no solo puede contribuir a la investigación sobre los linfomas, sino que, en principio, puede utilizarse para el estudio de diversas enfermedades tumorales, procesos inflamatorios y otros tejidos complejos».
Bruch considera un éxito especial la colaboración interdisciplinar entre la HHU, el UKD y el EMBL. «Hemos podido combinar la experiencia clínica y experimental de Düsseldorf con la competencia metodológica del EMBL en bioinformática, ciencia de datos y desarrollo de software. Esta estrecha colaboración fue decisiva para crear una herramienta que, además de ser técnicamente potente, esté orientada a cuestiones biológicas y médicas concretas», se congratula Bruch.
Nota: Este artículo ha sido traducido utilizando un sistema informático sin intervención humana. LUMITOS ofrece estas traducciones automáticas para presentar una gama más amplia de noticias de actualidad. Como este artículo ha sido traducido con traducción automática, es posible que contenga errores de vocabulario, sintaxis o gramática. El artículo original en Alemán se puede encontrar aquí.