Suchmaschine erleichtert Vergleich von Gen-Daten im Web

20.08.2002

Braunschweig, 16. August 02 - Eine Gen-Suchmaschine im Internet erleichtert künftig Wissenschaftlern genetische Sequenzen zu vergleichen. Die frei zugängliche Suchmaschine "NGFN-BLAST" der Gesellschaft für Biotechnologische Forschung (GBF) ermöglicht den Zugriff auf die in genetischen Sequenzen verborgenen Informationen. Als laut eigenen Angaben erster öffentlicher BLAST-Server in Deutschland http://ngfnblast.gbf.de erlaube der Dienst den Sequenzvergleich mit speziellen, durch die Nutzergemeinde ausgewählte Untergruppen wie zum Beispiel Mensch, Maus oder Ratte, teilte die Gesellschaft mit.

Der BLAST-Server (BLAST steht für Basic Local Alignment Search Tool) ist Teil der Forschungsarbeiten der GBF im Nationalen Genomforschungsnetz (NGFN). Mitglieder aus dem NGFN erhalten einen bevorzugten Zugriff zu den Daten und können sich ihr Wunschmenü an Untergruppen zusammenstellen. Eine weitere Besonderheit des Dienstes ist der Verweis auf bereits patentierte Sequenzen, berichtet der Nachrichtendienst ddp.

Zurzeit gibt es drei öffentliche Gendatenbanken, die Sequenzvergleiche ermöglichen. Deren Daten werden in den USA, Großbritannien und Japan gesammelt und abgeglichen. Eine gezielte Suche ist oft sehr aufwendig, da bisher meist die passenden Gensequenzen aller in der Datenbank vorhandenen Organismen aufgelistet werden. Der NGFN-BLAST-Server greift auf diese Daten zurück, aktualisiert sie jedoch täglich, prüft sie auf Unstimmigkeiten und sortiert sie gemäß der gewünschten Untergruppen.

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