Fundadores da CARTANA criam a CubaseBio: 5,9 milhões de euros para transcriptómica 3D

O financiamento será utilizado para acelerar o desenvolvimento tecnológico e a comercialização da tecnologia transcriptómica espacial de próxima geração da empresa. Ao contrário das técnicas espaciais 2D convencionais, que estão limitadas a secções finas de tecido, a tecnologia da CubaseBio permite uma verdadeira análise tridimensional à escala. Esta tecnologia proporciona aos investigadores uma visão sem precedentes de estruturas complexas de tecidos em 3D.

A CubaseBio foi fundada em 2024 por Malte Kuhnemund, Xiaoyan Qian, Toon Verheyen e Paulius Mielinis. Entre os co-fundadores consultores científicos encontram-se Joshua Weinstein (Professor Assistente de Engenharia Molecular na UChicago) e Björn Högberg (Professor e diretor do departamento de Bioquímica Médica e Biofísica no Instituto Karolinska, Suécia). Ambos foram pioneiros na microscopia de ADN, um método de biologia espacial que constrói redes moleculares no interior de espécimes intactos para codificar a proximidade tridimensional entre transcrições. Estas redes são lidas por sequenciação de ADN para produzir uma matriz de proximidade, a partir da qual é reconstruída computacionalmente uma imagem 3D da expressão genética - captando tanto as coordenadas espaciais relativas como a informação da sequência ao nível dos nucleótidos numa única medição.

A tecnologia do CubaseBio baseia-se nos fundamentos construídos por Weinstein (UChicago) e por investigadores do Instituto Karolinska e do KTH, na Suécia - entre os quais Björn Högberg e Ian Hoffecker. O trabalho pioneiro de Högberg constituiu a base para a subvenção de transição do EIC "Spatial Fuseseq" atribuída ao CubaseBio. Kuhnemund, Ph.D., e Qian, Ph.D., são pioneiros experientes em biologia espacial e antigos co-fundadores da CARTANA, uma spinout do Scilifelab que foi pioneira na sequenciação in situ, que foi adquirida pela 10X Genomics em 2020 para formar a base da plataforma Xenium In Situ.

Kuhnemund (CEO) comentou: "A biologia é tridimensional. Queremos permitir a sua medição dessa forma. Estamos entusiasmados por sermos apoiados por fortes investidores em tecnologia das ciências da vida e pelo Conselho Europeu de Inovação, que premiou a nossa empresa pela elevada escalabilidade e pela capacidade de disrupção da nossa tecnologia."

Weinstein, que vai apresentar o seu trabalho sobre microscopia volumétrica de ADN na próxima reunião da AGBT em Orlando, afirmou: "A técnica de microscopia de ADN da CubaseBio oferece uma via escalável para a análise espacial-transcriptómica de amostras biológicas tridimensionais complexas, como organoides e organismos inteiros".