Comment les protistes fissurent les parois des algues
Orciraptor agilis produit un certain nombre d'enzymes et de protéines de liaison en partie nouvelles : ces enzymes pourraient être utiles dans des applications industrielles.
Une équipe de chercheurs dirigée par le Dr Sebastian Hess, de l'Institut de zoologie de l'Université de Cologne, a étudié l'expression des enzymes à activité glucidique chez l'organisme unicellulaire Orciraptor agilis par séquençage de l'ARN. L'Orciraptor est un "mangeur de protoplastes" et vit exclusivement du contenu cellulaire d'algues mortes. Pour ce faire, il doit pénétrer la paroi cellulaire cellulosique de sa proie. En collaboration avec des collègues du Centre de génomique comparative et de bioinformatique évolutive (CGEB) de Halifax, au Canada, les chercheurs de l'UoC ont pu identifier une enzyme clé possible pour l'acte alimentaire hautement spécialisé du protiste. Au contact des cellules d'algues, Orciraptor régule une enzyme qui devrait être capable de couper la cellulose végétale, d'après sa séquence génétique et sa structure 3D prédite. Cette enzyme pourrait aider le protiste à dissoudre les parois cellulaires des algues. Jusqu'à présent, la base moléculaire de la façon dont les protistes se nourrissant de protoplastes interagissent avec leurs proies n'était pas du tout claire. L'article "Comparative transcriptomics reveals the molecular toolkit used by an algivorous protist for cell wall perforation" publié dans la revue scientifique "Current Biology" jette désormais un peu de lumière sur ce phénomène.
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En outre, Orciraptor contient un certain nombre de protéines inattendues telles que des protéines de liaison à la chitine, une chitine synthase et plusieurs chitinases. La fonction potentielle de la chitine ou de biopolymères similaires chez le flagellé nu n'est toujours pas claire. Cependant, les enzymes suggèrent un rôle physiologique important de la chitine dans l'histoire de vie d'Orciraptor. Les enzymes qui décomposent les biopolymères récalcitrants tels que la cellulose et la chitine ont également une grande importance technologique et industrielle. Actuellement, les applications industrielles utilisent principalement des enzymes provenant de bactéries et de champignons - les organismes traditionnels de la biotechnologie microbienne. Dans l'article publié, le Dr Hess et ses collègues soulignent le potentiel biotechnologique encore inexploité des microeucaryotes non fongiques tels que l'Orciraptor.
L'Orciraptor a été découvert il y a une dizaine d'années dans des landes pauvres en nutriments et décrit par le Dr Hess pendant ses études de doctorat à l'Institut de botanique de l'Université de Cologne. Cependant, il existe de nombreux autres organismes unicellulaires qui présentent des stratégies alimentaires similaires, mais qui ne sont pas directement apparentés à l'Orciraptor. Actuellement, des dizaines de ces organismes sont cultivés et caractérisés génétiquement à l'Institut de zoologie. Tout cela est rendu possible par les récentes avancées technologiques dans le domaine du séquençage à haut débit. Toutefois, le travail avec les mangeurs de protoplastes nécessite également des connaissances particulières en matière de manipulation de micro-organismes exotiques. Les scientifiques sont convaincus qu'il est temps pour la biologie moderne de se tourner à nouveau vers la diversité des organismes non-modèles. Les données de notre étude sur l'Orciraptor montrent à quel point les futures analyses moléculaires de protistes peu connus seront fructueuses", a déclaré le Dr Hess.
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
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