Inteligencia artificial para descubrir anticuerpos terapéuticos

Un antiguo científico del EMBL funda una start-up -DenovAI- para un descubrimiento de anticuerpos más amplio, rápido y barato utilizando aprendizaje automático avanzado y biofísica computacional

21.12.2023

Los anticuerpos son una herramienta importante en el arsenal del sistema inmunitario humano contra las enfermedades. Se adhieren a bacterias, virus, hongos o toxinas y los marcan para destruirlos o eliminarlos del organismo.

Kinga Lubowiecka / EMBL

Pie de foto: Los científicos del EMBL que desarrollaron la tecnología basada en IA para diseñar proteínas que aprovechará DenovAI. De izquierda a derecha: Michael Jendrusch, Kashif Sadiq, Jan Korbel

Esta capacidad de reconocer y marcar moléculas y organismos extraños y nocivos es lo que permite el uso terapéutico de los anticuerpos, incluido el tratamiento o la prevención de enfermedades como el cáncer, así como enfermedades autoinmunes y metabólicas. Pero aunque los anticuerpos terapéuticos ofrecen un gran potencial, seleccionar un candidato prometedor entre miles de millones de posibles secuencias de anticuerpos es laborioso, caro y, en muchos casos, ineficaz para identificar anticuerpos funcionales.

Para hacer frente a este reto, Kashif Sadiq, antiguo científico del EMBL, ha fundado recientemente una empresa de nueva creación: DenovAI Biotech. La empresa creará una plataforma en el campo del diseño de proteínas de novo, un enfoque computacional para diseñar proteínas desde cero, en lugar de utilizar una estructura conocida. Principalmente, la empresa desarrollará una solución biofísica impulsada por IA que pueda descubrir posibles anticuerpos y pequeñas proteínas biológicas y sugerir cuáles de ellas podrían utilizarse con fines terapéuticos. En un futuro próximo, también podrá ofrecer capacidades que vayan más allá de la biología farmacéutica, incluidos el diagnóstico y el diseño de enzimas y biomateriales. DenovAI se basará en los recientes avances en la predicción de estructuras proteicas, algoritmos de inteligencia artificial, técnicas de biofísica molecular computacional y una mayor disponibilidad de estructuras antígeno-anticuerpo determinadas experimentalmente.

A través de DenovAI, Sadiq pretende combinar la IA y la biofísica para descubrir las secuencias y estructuras de anticuerpos capaces de reconocer y unirse fuertemente a cualquier antígeno proteico. "Este tipo de enfoque no se ha adoptado antes", afirma Sadiq. "Hemos asistido a grandes avances en el campo de los anticuerpos terapéuticos, desde el aumento del tamaño de las bibliotecas de anticuerpos hasta el descubrimiento orientado a la función, pero el proceso de desarrollo de nuevos fármacos sigue siendo increíblemente lento, enormemente caro e ineficaz. Con el apoyo de AION Labs y sus socios, esperamos desarrollar una solución de vanguardia que trastornará todo el campo, reduciendo los plazos de descubrimiento de meses a días. Esto podría ampliar drásticamente el alcance de la terapia con anticuerpos a muchas más enfermedades".

DenovAI es la segunda startup formada por AION Labs, con sede en Israel, que crea startups a través de un modelo de innovación único impulsado por BioMed X. Tras identificar retos específicos de I+D en la industria, lleva a cabo una búsqueda mundial de talentos para fundadores científicos. DenovAI cuenta con la inversión de las empresas farmacéuticas líderes Pfizer, AstraZeneca, Merck y Teva, con el apoyo de Amazon Web Services (AWS) y el respaldo financiero adicional de la Autoridad de Innovación de Israel y el Fondo de Biotecnología de Israel.

"Situada en la intersección entre la biofísica, la biotecnología y la IA, DenovAI tiene el potencial de revolucionar la innovación en el descubrimiento de fármacos. Ese es nuestro objetivo común", declaró Mati Gill, Director General de AION Labs. "Estamos deseando aportar a DenovAI nuestros sólidos recursos y nuestra tutoría mientras trabajamos juntos en el desarrollo de una solución para superar el reto farmacéutico de seleccionar fármacos candidatos a partir de secuencias de anticuerpos".

Durante el tiempo que trabajó en el grupo de investigación de Jan Korbel en el EMBL de Heidelberg, Sadiq y el estudiante de doctorado del EMBL Michael Jendrusch inventaron una tecnología basada en IA para diseñar proteínas. Con DenovAI, Sadiq pretende aprovechar esta tecnología, cuya licencia le ha sido concedida por la filial comercial del EMBL: EMBL Enterprise Management Technology Transfer GmbH (EMBLEM). Jendrusch también contribuirá a los esfuerzos de la empresa mientras completa su doctorado en el EMBL de Heidelberg. "Para mí es una oportunidad fantástica participar en la traducción de nuestra investigación teórica en aplicaciones de la vida real", dijo Jendrusch.

Nota: Este artículo ha sido traducido utilizando un sistema informático sin intervención humana. LUMITOS ofrece estas traducciones automáticas para presentar una gama más amplia de noticias de actualidad. Como este artículo ha sido traducido con traducción automática, es posible que contenga errores de vocabulario, sintaxis o gramática. El artículo original en Inglés se puede encontrar aquí.

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