18.01.2021 - baseclick GmbH

Nuevo y muy eficiente método para el análisis de las mutaciones del SARS-CoV-2

Las mutaciones pueden ser asignadas directamente sin ningún paso matemático intermedio

La rápida difusión de la nueva variante B.1.1.7 del virus del SARS-CoV-2 en Gran Bretaña y otros países demuestra que los cambios en el genoma del virus del SARS-CoV-2 pueden dar lugar a nuevas propiedades biológicas.

La mayoría de las aproximadamente 12.000 mutaciones del genoma del virus del SARS-CoV-2 que se han identificado desde febrero de 2020 hasta la fecha no modificaron las propiedades biológicas del virus. Sin embargo, algunas de las casi 4.000 mutaciones que se han identificado en la proteína punta (proteína S) han influido en las propiedades biológicas de infectividad, progresión de la enfermedad e inmunogenicidad del virus del SARS-CoV-2 mutante. En la primavera de 2020, la aparición de la mutación D614G en la proteína S condujo a un aumento de la infecciosidad de esta nueva cepa mutante del SARS-CoV-2 y ha reemplazado casi por completo a la cepa de Wuhan en todo el mundo. La mutación A222V en la cepa española (20A.EU1), condujo de nuevo a un aumento de la infectividad y comenzó a sustituir a la cepa D614G en Europa en el verano de 2020. La mutación N501Y-del69-70 en B.1.1.7 en Gran Bretaña, que se detectó por primera vez en noviembre de 2020, condujo una vez más a un aumento de la infecciosidad. Desde entonces las reinfecciones también han aumentado con la aparición de estas nuevas cepas de virus. Con la aparición de B.1.1.7, la eficacia de las vacunas fue cuestionada y ahora se está investigando.

Por lo tanto, es cada vez más importante contener y gestionar el progreso de la infección no sólo mediante la detección de una infección por SARS-CoV-2, por ejemplo, mediante la PCR, sino también mediante un análisis genético de la cepa infectante.

Actualmente, el análisis genético del SARS-CoV-2 se basa en los métodos de Amplicon. La parte del genoma responsable de la infecciosidad, la progresión de la enfermedad y la inmunogenicidad se disecciona en pequeñas secciones y posteriormente se secuencializa. Las mutaciones y, por lo tanto, las posibles nuevas variantes del virus se determinan mediante métodos matemáticos. En cambio, el baseclick ha desarrollado un nuevo y más eficiente proceso para determinar no sólo las mutaciones predominantes sino también las mutaciones menores que se producen en una población de virus que podrían convertirse eventualmente en nuevas cepas.

El Director General de baseclick, Dr. Thomas Frischmuth: "Es una buena noticia que baseclick haya desarrollado ahora un método de análisis altamente eficiente para analizar las mutaciones del SARS-CoV-2 desde el aumento de la aparición de nuevas cepas del virus SARSCoV-2. Con nuestro kit de secuenciación, la sección del genoma responsable de la infectividad, la progresión de la enfermedad y la inmunogenicidad se analiza directamente y las mutaciones pueden asignarse directamente sin ningún paso matemático intermedio".

El "Click Tech Single Strain Mutation Mapping Kit for Sars-Co-V2" desarrollado por baseclick GmbH, junto con los métodos de secuenciación de "lectura larga", por ejemplo los proporcionados por Pacific Biosciences, permite una asignación genómica exacta y una evaluación de la frecuencia de las nuevas variantes de virus emergentes en la población. Con el método de análisis también es posible identificar todas las mutaciones del SARS-CoV-2 en un paciente con COVID-19, incluidas las que se producen en el curso de la enfermedad.

El Dr. Thomas Frischmuth, CEO de Baseclick: "La investigación de las mutaciones del SARS-CoV-2 y de las cepas de virus emergentes apenas está comenzando. Más conocimiento sobre esto apoyará el desarrollo de vacunas, terapias y el manejo de esta pandemia, y estamos haciendo una nueva y decisiva contribución a esto".

Nota: Este artículo ha sido traducido utilizando un sistema informático sin intervención humana. LUMITOS ofrece estas traducciones automáticas para presentar una gama más amplia de noticias de actualidad. Como este artículo ha sido traducido con traducción automática, es posible que contenga errores de vocabulario, sintaxis o gramática. El artículo original en Inglés se puede encontrar aquí.

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