Chromodomäne

Eine Chromodomäne ist eine Proteindomäne, die zuerst in den Drosophila melanogaster-Proteinen Polycomb (Pc) und Heterochromatin Protein 1 (HP1) identifiziert wurde.

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Die Aufgabe dieser Domäne in Drosophila ist wahrscheinlich der Transport und die Bindung von Pc und HP1 an das Heterochromatin und andere Chromatinkomponenten. Somit spielen Chromodomänen eine Rolle beim Chromatin-Remodeling und der Bildung von Heterochromatin-Regionen, insbesondere im Stilllegen von Genen, dem so genannten "epigenetic silencing" oder "Gen-Silencing" ^[1]. Chromodomänen erkennen und binden N-termini, die methylierte Lysine aufweisen. Dabei bindet die Chromodomäne von Pc an die methylierte Histonmodifikation H3K27 (Histon 3, Lysin 27), die HP1 Chromodomäne an die di- und trimethylierte Histonmodifikation H3K9 (Histon 3, Lysin 9)^[2]. Chromodomänen sind ein Bestandteil des RNA-induzierten transkriptionellen Silencing-Komplex (RITS-Komplex) ^[3].

Bekannte Proteine mit Chromodomänen sind HP1, Polycomb, die Histon-Methyltransferase Suv(3)9, die Helicase CHD und das Retinoblastoma-Bindungsprotein 1 (RBP1) ^[4].

Quellen

1. ↑ Jones DO, Cowell IG, Singh PB. (2000). Mammalian chromodomain proteins: their role in genome organisation and expression. Bioessays 22(2):124-37. PMID 10655032
2. ↑ Bannister AJ, Zegerman P, Partridge JF, Miska EA, Thomas JO, Allshire RC & Kouzarides, T. Selective recognition of methylated lysine 9 on histone H3 by the HP1 chromodomain. Nature 410, 120-4 (2001) PMID 1124205
3. ↑ Verdel A, Jia S, Gerber S, Sugiyama T, Gygi S, Grewal S, Moazed D (2004). "RNAi-mediated targeting of heterochromatin by the RITS complex". Science 303 (5658): 672-6. PMID 14704433
4. ↑ Singh PB, Georgatos SD. HP1: facts, open questions, and speculation. J Struct Biol. 2002 Oct-Dec;140(1-3):10-6. Review PMID 12490149