Isoschizomer

Als Isoschizomere werden in der Molekularbiologie Paare oder Gruppen von Restriktionsenzymen bezeichnet, welche eine Spezifität für die gleiche DNA-Erkennungssequenz besitzen und diese in gleicher Weise spalten. So schneiden beispielsweise sowohl SphI als auch BbuI oder PaeI die DNA an der Erkennungssequenz CGTACG wie folgt:

5'-CGTAC       G-3'
3'-G       CATGC-5'

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Weitere Beispiele für Isoschizomerenpaare sind AvaII - SinI, CfoI - HhaI und HpaII - MspI. Abgesehen von der Gleichheit der Restriktionssequenz bestehen zwischen Isoschizomeren oft keine größeren Ähnlichkeiten. Diese Enzyme werden aus verschiedenen Bakterienstämmen isoliert und stellen oft unterschiedliche Ansprüche an einen optimalen Restriktionsverdau.