Décodage du génome de la tortue géante d'Aldabra, une espèce menacée

La prochaine étape consistera à étudier comment l'ADN peut être utilisé pour déterminer l'âge des animaux encore vivants

13.10.2022 - Suisse

Elles peuvent vivre plus de 100 ans et peser jusqu'à 250 kilogrammes - les tortues géantes d'Aldabra. Des chercheurs de l'Université de Zurich ont décodé le génome d'Aldabrachelys gigantea, l'une des deux seules espèces de tortues géantes encore présentes dans le monde. Ces résultats contribueront à assurer la survie à long terme de cette espèce menacée.

Dennis Hansen, UZH

Les seules tortues géantes d'Aldabra encore en vie à l'état sauvage se trouvent sur l'atoll d'Aldabra, au nord-ouest de Madagascar.

Les tortues géantes d'Aldabra sont vulnérables à l'extinction selon la liste rouge de l'Union internationale pour la conservation de la nature, ce qui signifie que l'espèce est confrontée à un risque élevé d'extinction à l'état sauvage. Les seuls animaux survivants à l'état sauvage se trouvent sur l'atoll d'Aldabra, au nord-ouest de Madagascar, dans l'océan Indien. En raison de leur rôle central dans les écosystèmes insulaires, ils ont été utilisés avec succès dans le cadre de projets de réaménagement de plusieurs îles de l'océan Indien occidental dont les espèces endémiques de tortues géantes sont aujourd'hui éteintes. En d'autres termes, les tortues géantes d'Aldabra agissent comme des ingénieurs de l'écosystème pour restaurer les habitats insulaires dégradés. Disposer de davantage d'outils et de ressources, notamment d'informations génétiques, est l'un des meilleurs moyens d'assurer le succès à long terme des populations sauvages et réensauvagées.

Maintenir la diversité génétique

Des chercheurs de l'Université de Zurich ont réussi à déchiffrer le génome d'une tortue géante d'Aldabra et à assembler le code génétique complet de l'espèce au niveau des chromosomes. Ce génome de référence permet de déterminer les différences génétiques entre les individus de la tortue géante d'Aldabra. "Ces informations génomiques sont cruciales pour que les programmes de reproduction dans les zoos puissent représenter la diversité génétique que l'on trouve dans la nature", explique Gözde Çilingir, premier auteur de l'étude. En outre, les données pourraient être utilisées pour des études sur d'autres espèces de tortues. "Nous avons constaté que la majeure partie du génome est similaire à d'autres génomes connus de tortues", explique Çilingir. "Cela signifie que nos données aideront les efforts de conservation d'autres espèces de tortues à travers l'Afrique de l'Est et Madagascar."

Génome de référence provenant d'un animal de zoo

Le génome de référence provient d'une tortue géante d'Aldabra femelle (connue sous le nom de Hermania) qui vit au zoo de Zurich. En comparant le génome de référence avec celui de 30 tortues vivant sur l'atoll d'Aldabra, les chercheurs ont pu démontrer la valeur pratique des génomes de référence pour la conservation des espèces. Ils ont non seulement pu déterminer les différences génétiques entre les populations de l'atoll, mais aussi indiquer de quelle population Hermania était très probablement issue. Les biologistes de l'évolution ont également identifié des mutations potentiellement dangereuses qui pourraient mettre en péril la santé à long terme des populations et devraient donc être surveillées.

De nouvelles perspectives pour une durée de vie exceptionnellement longue

Le génome décodé par les chercheurs de l'UZH pourrait servir de base à de futures études visant à comprendre les fondements génétiques de la durée de vie exceptionnellement longue de l'espèce. La prochaine étape consistera à étudier comment l'ADN peut être utilisé pour déterminer l'âge des animaux encore en vie, car l'âge exact de ces animaux à longue durée de vie est souvent inconnu.

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