Als Standortflora (oder Kolonisationsflora, Residente Keime oder Kommensale) bezeichnet man Mikroorganismen, die auf der inneren und äußeren Körperoberfläche des Menschen und anderer Lebewesen leben, normalerweise ohne eine Infektion und eine Erkrankung hervorzurufen.
Die Darmflora setzt sich zu 99% aus Anaerobiern und ca. 1% aus den medizinisch bedeutsameren fakultativ anaeroben Bakterien zusammen, die direkt an der Schleimhaut leben.