Next Generation Sequencing: Neues Kit ermöglicht hochauflösende Analyse mikrobieller Gemeinschaften

Molzym – Innovative Produkte für die molekulare Mikrobiologie
Durch die völlig neuen Möglichkeiten neuerer Sequenziertechnologien (NGS, Next Generation Sequencing) und DNA-Chip-Technologien ist es nun möglich Biofilme, Vielfachinfektionen und komplexe mikrobielle Gemeinschaften unabhängig von ihrer Kultivierbarkeit direkt aus klinischem Material zu untersuchen. Während die herkömmliche 16S-PCR- und Sequenziertechnologie meist nur wenige Erreger identifizieren konnte, können NGS-Verfahren mit wesentlich gesteigerter Tiefe  Mikroorganismengemeinschaften in einer Probe auflösen. Bislang wurde diese erhöhte Darstellungsschärfe jedoch durch humane Hintergrund-DNA und Kontaminationen der verwendeten Reagenzien begrenzt. Zudem war es kaum bzw. nur mit hohem Aufwand möglich, zwischen toten und lebenden Zellen zu unterscheiden.

„Ultra-Deep Microbiome NGS Kit“
Ultra-Deep Microbiome NGS™ ist ein neues Kit, das erstmals die  hochgradige Anreicherung von lebenden Mikroorganismen in einer klinischen Probe und damit die genauere Identifizierung mittels Sequenziertechniken wie NGS ermöglicht. Die humane Hintergrund-DNA wird dabei ebenso abgebaut wie die DNA toter Mikroorganismen. Mittels hochreiner, DNA-freier Isolierungsreagenzien kann Mikrobiom-DNA ohne Kontaminationen präpariert werden. Dies erhöht die Genauigkeit der NGS-Analysen entscheidend. Interne Kontrollen gestatten den Aufbau einer Qualitätskontrolle über die Güte der Mikrobiom-DNA und Kalibratoren ermöglichen erstmals quantitative Aussagen des NGS-Prozesses. Hochreine PCR-Mastermixe für Kundenspezifische Primeranwendungen erlauben darüber hinaus die Entwicklung eigener Kontaminations-freier NGS-Assays.

Produkteigenschaften:

• Ultra-hochauflösende Analyse von humanen Mikrobiomen
• Analyse lebender Gemeinschaften durch Beseitigung „toter“ DNA
• Kontaminationsfrei: Validierte, kontaminationsfreie Reagenzien (100% DNA-frei)
• Universal: Validiert für über 345 Bakterien und Pilze
• Protokolle für eine Vielzahl humaner Primärmaterialien
• Kombinierbar mit Illumina, 454, SOLiD, Helicos, Sanger, Digital PCR, DNA-Arrays
• Komplett-Kit: Anreicherung lebender Mikroben, DNA-Isolierung, PCR-Reagenzien, interne Kontrolle, Kalibratoren

Handhabung
Das Komplett-Kit enthält die erforderlichen Reagenzien und Verbrauchsmittel, lediglich Kundenspezifische Primer, die Reagenzien zur Synthese der Sequenzbibliothek und die Sequenzierreagenzien müssen zugekauft werden. Ultra-Deep Microbiome NGS kann mit der Standard-Ausrüstung eines molekularbiologischen Labors durchgeführt werden und ist validiert mit Körperflüssigkeiten wie Blut, Synovialflüssigkeit, CSF, Aszitesflüssigkeit, Bronchiallavage, Pleuraflüssigkeit, Blutkulturproben, Abstriche, und Gewebe, einschließlich Biopsien von der Haut, Abszessen und inneren Organen wie Herzklappengewebe.

Für detaillierte Informationen und Publikationen, ein Test-Angebot oder eine Präsentation bei Ihnen im Labor kontaktieren Sie bitte das Support-Team von Molzym.